En bref

Logiciels de facturation : ce qu'il faut retenir

  • Logiciels gratuits : Indy, Henrri et Abby permettent de créer des devis et factures illimités sans abonnement.
  • Solutions les plus complètes : Qonto et Shine Facture combinent outil de facturation, suivi des paiements et synchronisation avec un compte bancaire professionnel.
  • Réforme 2026 : à partir du 1er septembre 2026, les factures devront transiter par une plateforme agréée (PDP). Anticipez en choisissant un logiciel déjà conforme.

C'est quoi un logiciel de facturation en ligne ?

Un logiciel de facturation en ligne est un outil pratique qui permet de créer, envoyer et gérer vos devis et factures directement depuis un navigateur web. Il centralise toutes vos opérations commerciales, en regroupant la gestion des clients, des documents, des paiements et de l'historique de vos transactions.

Sa fonction principale est de générer des devis et des factures conformes à la réglementation. Le logiciel insère automatiquement les mentions obligatoires, calcule la TVA et numérote vos documents. Vous évitez ainsi les erreurs et assurez une conformité totale avec la législation en vigueur.

Un logiciel de facturation en ligne offre également de nombreuses fonctionnalités :

  • Transformer un devis en facture en un seul clic, sans ressaisir les informations ;
  • Suivre les paiements et identifier rapidement les factures en attente ;
  • Automatiser les relances en cas d'impayé, réduisant le risque d'oublis ;
  • Générer des rapports détaillés sur le chiffre d'affaires et les performances de votre entreprise.

Certains logiciels proposent des fonctionnalités avancées, comme le paiement en ligne, la connexion au compte bancaire professionnel, ou encore la préparation à la facturation électronique obligatoire dès 2026.

Un logiciel de facturation est-il obligatoire ?

Non, la loi n'impose pas l'utilisation d'un logiciel de facturation. Il est tout à fait possible de créer ses factures sur Excel ou Word, à condition de respecter les mentions obligatoires et d'assurer une numérotation correcte des documents.

Cependant, la réforme de la facturation électronique change la donne. Dès le 1er septembre 2026, toutes les entreprises devront être capables de recevoir des factures électroniques, puis de les émettre dans ce format entre 2026 et 2027 selon leur taille. Toutes les factures devront transiter par une plateforme agréée, garantissant sécurité et traçabilité des échanges.

Les meilleurs logiciels de facturation en 2026

Voici notre comparatif des principaux logiciels de facturation en 2026 :

Meilleurs logiciels de facturation en 2026

Comparatif des principaux logiciels de facturation en 2026
Logiciel Prix Cible Devis et factures illimités Personnalisation Fonctionnalités additionnelles
Logo Facture.net Gratuit
Auto-entrepreneurs TPE PME
  • Logiciel CRM
  • Factures conformes et sécurisées
Logo Indy Gratuit + Payante à partir de 9 € HT/mois
Auto-entrepreneurs
  • Comptabilité automatisée
  • Synchronisation bancaire
  • Déclarations fiscales
  • Facturation électronique conforme 2026
  • Suivi des seuils TVA / micro
Logo Abby Version gratuite + Payante à partir de 9 € HT/mois
Auto-entrepreneurs
  • Déclaration URSSAF
  • Avance de crédit d'impôt URSSAF
  • Outil de gestion de projet
Logo Henrri Version gratuite + Payante à partir de 17 € HT/mois
Auto-entrepreneurs TPE PME
  • Suivi d'activité
  • Gestion clients
  • Comptabilité
  • Signature électronique
Logo Shine Facture Version gratuite + Payante à partir de 9 € HT/mois
Auto-entrepreneurs TPE
  • Outil comptable intégré
  • Gestion des relances clients
Logo Qonto Dès 9 € HT/mois
TPE PME
  • Gestion des notes de frais
  • Synchronisation des comptes bancaires externes
Logo Pennylane À partir de 14 € HT/mois
Auto-entrepreneurs TPE PME
  • Tableaux de bord personnalisables
  • Circuits d'approbation personnalisables
  • Compte bancaire pro
Logo Obat À partir de 25 € HT/mois
Micro TPE PME dans le bâtiment
  • Bibliothèque de prix Obat
  • Gestion des équipes
  • Compte bancaire pro
  • Assurance décennale et mutuelle employés
  • Gestion CRM
Logo Axonaut À partir de 34,99 € HT/mois
TPE PME
  • Compte bancaire pro
  • Module comptabilité et trésorerie
  • Gestion de stock
  • Module RH avec gestion des absences
  • Gestion ticketing
  • Module CRM et marketing

Source : grilles tarifaires officielles, mises à jour en mai 2026.

Auto-entrepreneur : quel est le meilleur logiciel de facturation ?

Logo Indy

Pour un auto-entrepreneur, le meilleur logiciel de facturation doit être simple, gratuit et conforme à la facturation électronique 2026.

Notre recommandation : Indy.

  • Devis et factures illimités gratuits ;
  • Compte pro intégré ;
  • Synchronisation bancaire ;
  • Plateforme agréée pour 2026.

Conseil d'expert

Idéal si vous voulez centraliser facturation et trésorerie dans un seul outil.

Carte Essentiel
de Indy

Essentiel

Gratuite Mastercard Débit immédiat
Formes juridiques : Micro-entreprise, EI, SASU, EURL, SAS, SARL, SCI, LMNP
Selectra Score A
Prix mensuel
0 €
/mois HT
Plafond paiement
10 000 €
par mois
Dépôt de capital
Gratuit
Solutions TPE
24 €
HT
Carte gratuite
Virements et prélèvements illimités
Comptabilité automatisée
Voir le détail complet Voir moins

Frais

Dépôt de chèque Non disponible
Dépôt d'espèces Non disponible
Virement SEPA sortant Non disponible
Virement SWIFT sortant Non disponible

Services

Découvert autorisé Aucun découvert autorisé
Création d'entreprise Gratuit
Frais de retrait (zone euro) Gratuits et illimités

Solutions TPE compatibles

  • Sumup · 24 € HT · 1,49 % par transaction

Points forts

Carte gratuite
Virements et prélèvements illimités
Comptabilité automatisée
Dépot de capital gratuit avec délivrance du certificat de dépôt sous 24h ouvrées
Module de création d'entreprise gratuit : conseil sur les statuts, régime fiscal, aides et réception rapide des documents, formalités 100% en ligne
Devis et factures illimités
Gestion note de frais par photo
Auto-détection de la TVA
Offres partenaires premium
Application mobile pour un suivi quotidien

Points faibles

Carte à autorisation systématique
Aucune assurance
Pas de découvert autorisé
Pas adapté aux organismes de formation, ni aux restaurateurs, ni aux artisans du BTP
Pas de dépôt de chèque
Paiement et retrait d'espèces payants à l'étranger
Seulement 2 retraits gratuits en zone euro
Carte Plus
de Indy

Plus

9 €/mois HT Mastercard Débit immédiat
Formes juridiques : Micro-entreprise, EI, SASU, EURL, SAS, SARL, SCI, LMNP
Selectra Score A
Prix mensuel
9 €
/mois HT
Plafond paiement
10 000 €
par mois
Dépôt de capital
Gratuit
Solutions TPE
24 €
HT
Virements et prélèvements illimités
Dépot de capital gratuit avec délivrance du certificat de dépôt sous 24h ouvrées
Module de création d'entreprise gratuit : conseil sur les statuts, régime fiscal, aides et réception rapide des documents, formalités 100% en ligne
Voir le détail complet Voir moins

Frais

Dépôt de chèque Non disponible
Dépôt d'espèces Non disponible
Virement SEPA sortant Non disponible
Virement SWIFT sortant Non disponible

Services

Découvert autorisé Aucun découvert autorisé
Création d'entreprise Gratuit
Frais de retrait (zone euro) Gratuits et illimités

Solutions TPE compatibles

  • Sumup · 24 € HT · 1,49 % par transaction

Points forts

Virements et prélèvements illimités
Dépot de capital gratuit avec délivrance du certificat de dépôt sous 24h ouvrées
Module de création d'entreprise gratuit : conseil sur les statuts, régime fiscal, aides et réception rapide des documents, formalités 100% en ligne
Devis et factures illimités
Offres partenaires premium
Application mobile pour un suivi quotidien
Jusqu'à 3 sous-comptes

Points faibles

Offre de compte payant
Carte à autorisation systématique
Aucune assurance
Pas de découvert autorisé
Pas adapté aux organismes de formation, ni aux restaurateurs, ni aux artisans du BTP
Paiement et retrait à l'étranger payants
Pas de dépôt de chèques
Seulement 2 retraits gratuits en zone euro
Carte Premium
de Indy

Premium

12 €/mois HT Mastercard Débit immédiat
Formes juridiques : Micro-entreprise, EI, SASU, EURL, SAS, SARL, SCI, LMNP
Selectra Score A
Prix mensuel
12 €
/mois HT
Plafond paiement
10 000 €
par mois
Dépôt de capital
Gratuit
Solutions TPE
24 €
HT
Virements et prélèvements illimités
Comptabilité automatisée
Dépot de capital gratuit avec délivrance du certificat de dépôt sous 24h ouvrées
Voir le détail complet Voir moins

Frais

Dépôt de chèque Non disponible
Dépôt d'espèces Non disponible
Virement SEPA sortant Non disponible
Virement SWIFT sortant Non disponible

Services

Découvert autorisé Aucun découvert autorisé
Création d'entreprise Gratuit
Frais de retrait (zone euro) Gratuits et illimités

Solutions TPE compatibles

  • Sumup · 24 € HT · 1,49 % par transaction

Points forts

Virements et prélèvements illimités
Comptabilité automatisée
Dépot de capital gratuit avec délivrance du certificat de dépôt sous 24h ouvrées
Module de création d'entreprise gratuit : conseil sur les statuts, régime fiscal, aides et réception rapide des documents, formalités 100% en ligne
Devis et factures illimités
Offres partenaires premium
Application mobile pour un suivi quotidien
Aide à la déclaration Urssaf, de TVA, des impôts et autres déclarations obligatoires

Points faibles

Offre de compte payant
Carte à autorisation systématique
Aucune assurance
Pas de découvert autorisé
Pas adapté aux organismes de formation, ni aux restaurateurs, ni aux artisans du BTP
Paiement et retrait à l'étranger payants
Pas de dépôt de chèques
Seulement 2 retraits gratuits en zone euro

Classement par prix mensuel croissant : l'offre la moins chère apparaît en premier. Sélection d'offres bancaires : liste non exhaustive. Mis à jour le 7 mai 2026.

TPE : quel logiciel de facturation choisir ?

Logo Henrri

Pour une TPE, l'enjeu change : le volume de factures augmente, la gestion devient plus structurée et la conformité fiscale devient essentielle.

Notre recommandation : Henrri.

  • Devis et factures illimités ;
  • Suivi des paiements ;
  • Gestion des avoirs ;
  • Compatible facturation électronique ;
  • Gratuit sans abonnement.

Conseil d'expert

Si votre priorité est de limiter les coûts tout en ayant un outil fiable pour gérer votre facturation, Henrri est une excellente base.

PME : quel logiciel de facturation choisir ?

Logo Qonto

Pour une PME, la priorité est la centralisation et l'automatisation.

Notre recommandation : Qonto.

  • Centralisation facturation + paiements + trésorerie ;
  • Compte professionnel intégré ;
  • Intégrations comptables avancées ;
  • Gestion multi-utilisateurs.

Conseil d'expert

Pour une PME en croissance, mieux vaut choisir un outil capable d'évoluer avec votre structure. Qonto offre cette scalabilité.

Carte Basic
de Qonto

Basic

9 €/mois HT Mastercard Débit immédiat
Formes juridiques : SAS, SASU, SARL, EURL, SC, micro-entreprises, professions libérales ainsi que les associations
Selectra Score A
Prix mensuel
9 €
/mois HT
Plafond paiement
20 000 €
par mois
Dépôt de capital
69 €
HT
Solutions TPE
9 €
HT
Assurances voyage incluses
Virement à 0,40€ (contre 1€ chez la plupart des concurrents)
Support client 7j/7 par chat, email et téléphone (8h à 20h)
Voir le détail complet Voir moins

Frais

Dépôt de chèque 2,00 €/chèque
Dépôt d'espèces Non disponible
Virement SEPA sortant 30 gratuits/mois puis 0,40 € / op
Virement SWIFT sortant 0,80 %

Services

Découvert autorisé Aucun découvert autorisé
Création d'entreprise Gratuit
Frais de retrait (zone euro) 2€ par retrait

Solutions TPE compatibles

  • Zettle Reader 2 · 9 € HT · 1,65 % par transaction

Points forts

Assurances voyage incluses
Virement à 0,40€ (contre 1€ chez la plupart des concurrents)
Support client 7j/7 par chat, email et téléphone (8h à 20h)
Carte Plus disponible pour 8€ / mois et 20€ / mois pour Carte X
Terminal de paiement disponible à 9€HT puis 1,65% de commission
+ 2 000 intégrations partenaires

Points faibles

Offre de compte payant et élevée par rapport aux concurrents
Plafonds de retrait faibles (retraits jusqu’à 1 000€/mois)
Pas de découvert autorisé
Enciassement des chèques par voie postale
Virements entrants depuis l'étranger à 5€ HT/virement
Aucun chèque inclus dans le forfait (2€ par chèque encaissé hors forfait)
Carte virtuelle à 2€/mois
Carte Business PME
de Qonto

Business PME

99 €/mois HT Mastercard Débit immédiat
Formes juridiques : Tous types d'entreprise (de l'association à la société anonyme)
Selectra Score A
Prix mensuel
99 €
/mois HT
Plafond paiement
20 000 €
par mois
Dépôt de capital
69 €
HT
Solutions TPE
9 €
HT
10 cartes One Mastercard
500 virements ou prélèvements gratuits par mois
1 compte + 9 sous-comptes
Voir le détail complet Voir moins

Frais

Dépôt de chèque 2,00 €/chèque
Dépôt d'espèces Non disponible
Virement SEPA sortant Non disponible
Virement SWIFT sortant 0,56 %

Services

Découvert autorisé Aucun découvert autorisé
Création d'entreprise Gratuit
Frais de retrait (zone euro) Gratuits et illimités

Solutions TPE compatibles

  • Zettle Reader 2 · 9 € HT · 1,65 % par transaction

Points forts

10 cartes One Mastercard
500 virements ou prélèvements gratuits par mois
1 compte + 9 sous-comptes
Accès comptable + aide à la comptabilité (reçus numérisés et certifiés)
Conseiller dédié + support client prioritaire 24h/24 et 7j/7
50 cartes virtuelles par mois (1€/mois par carte additionnelle)
+ 2 000 intégrations partenaires
Membres d'équipe illimités + Role de Manager
Carte Plus disponible pour 8€ / mois et 20€ / mois pour Carte X

Points faibles

Coût élevé
Aucun accompagnement sur les bilans et les déclarations URSSAF, déclarations d’impôts
Absence de découvert autorisé
Encaissement des chèques par voie postale
Carte Enterprise PME
de Qonto

Enterprise PME

199 €/mois HT Mastercard Débit immédiat
Formes juridiques : Tous types d'entreprise (de l'association à la société anonyme)
Selectra Score A
Prix mensuel
199 €
/mois HT
Plafond paiement
20 000 €
par mois
Dépôt de capital
69 €
HT
Solutions TPE
9 €
HT
30 cartes One Mastercard
1 000 virements ou prélèvements gratuits par mois
1 compte + 24 sous-comptes
Voir le détail complet Voir moins

Frais

Dépôt de chèque 2,00 €/chèque
Dépôt d'espèces Non disponible
Virement SEPA sortant Non disponible
Virement SWIFT sortant 0,56 %

Services

Découvert autorisé Aucun découvert autorisé
Création d'entreprise Gratuit
Frais de retrait (zone euro) Gratuits et illimités

Solutions TPE compatibles

  • Zettle Reader 2 · 9 € HT · 1,65 % par transaction

Points forts

30 cartes One Mastercard
1 000 virements ou prélèvements gratuits par mois
1 compte + 24 sous-comptes
Accès comptable + aide à la comptabilité (reçus numérisés et certifiés)
Conseiller dédié + support client prioritaire 24h/24 et 7j/7
50 cartes virtuelles par mois (1€/mois par carte additionnelle)
+ 2 000 intégrations partenaires
Membres d'équipe illimités + Role de Manager
Carte Plus disponible pour 8€ / mois et 20€ / mois pour Carte X

Points faibles

Coût élevé
Aucun accompagnement sur les bilans et les déclarations URSSAF, déclarations d’impô
Absence de découvert autorisé
Encaissement des chèques par voie postale

Classement par prix mensuel croissant : l'offre la moins chère apparaît en premier. Sélection d'offres bancaires : liste non exhaustive. Mis à jour le 7 mai 2026.

Facturation électronique : quelles sont les nouvelles obligations en 2026 ?

La réforme de la facturation électronique impose à toutes les entreprises assujetties à la TVA d'émettre et de recevoir leurs factures dans un format électronique structuré.

Qui est concerné ?

Cette réforme concerne tous les professionnels : indépendants, micro-entrepreneurs, TPE, PME et grandes entreprises.

Le calendrier est progressif :

  • 1er septembre 2026 : toutes les entreprises devront pouvoir recevoir des factures électroniques ;
  • 1er septembre 2026 : les grandes entreprises et ETI devront aussi émettre leurs factures sous ce format ;
  • 1er septembre 2027 : les PME, TPE et micro-entreprises devront à leur tour émettre des factures électroniques.

Plus de PDF par email à partir de 2026

Les factures ne pourront plus être envoyées directement par email en PDF. Elles devront passer par une plateforme de dématérialisation agréée, connectée à l'administration fiscale. Sans logiciel adapté, il ne sera plus possible d'émettre des factures conformes à partir de 2026-2027.

Quelles sont les fonctionnalités d'un logiciel de facturation ?

Voici les fonctionnalités de base incluses dans tous les logiciels de facturation gratuits :

  • Création de devis, factures et avoirs avec les mentions obligatoires ;
  • Numérotation automatique et calcul de la TVA ;
  • Transformation d'un devis en facture en un clic ;
  • Envoi des factures par email ;
  • Suivi des paiements et identification des factures en attente ou en retard ;
  • Relances automatiques des clients ;
  • Personnalisation des factures avec logo et informations de l'entreprise.

Fonctionnalités ajoutées par les versions payantes

Les versions payantes ajoutent des fonctionnalités pour automatiser toute la gestion financière :

  • Facturation électronique compatible avec la réforme 2026 ;
  • Création de factures récurrentes automatiques ;
  • Synchronisation avec un compte bancaire professionnel ;
  • Intégration avec un logiciel comptable ou un CRM ;
  • Paiement en ligne par carte bancaire ou prélèvement ;
  • Tableaux de bord et suivi détaillé du chiffre d'affaires.

Comment choisir le meilleur logiciel de facturation ?

Pour choisir le bon logiciel de facturation, vérifiez ces 5 critères :

  1. Prix et limites.

    Choisir entre gratuit ou payant avec fonctionnalités avancées. Les versions gratuites couvrent l'essentiel ; au-delà, les abonnements donnent accès à l'automatisation, la facturation électronique et les intégrations.

  2. Conformité 2026.

    À partir du 1er septembre 2026, toutes les entreprises devront transmettre leurs factures via une plateforme agréée ou un logiciel compatible.

  3. Fonctionnalités.

    Choisissez un logiciel qui correspond exactement à vos besoins actuels et futurs.

  4. Statut juridique.

    Votre choix dépend aussi de votre statut. Les auto-entrepreneurs peuvent se contenter d'un outil gratuit, tandis que les sociétés (SARL, SAS, SASU, EURL) bénéficieront d'un logiciel connecté à leur expert-comptable ou à leur compte bancaire professionnel. Prévoyez la possibilité d'évoluer vers une offre plus complète au fur et à mesure de la croissance de votre activité.

  5. Intégrations disponibles.

    Un bon logiciel de facturation doit pouvoir se connecter facilement à vos outils existants : banque, CRM, comptabilité, etc. Ces intégrations évitent les ressaisies et simplifient la gestion quotidienne.

Conseil d'expert

Optez pour un outil évolutif, adapté à votre activité, qui centralise facturation et trésorerie pour gagner du temps.

Questions fréquentes sur les logiciels de facturation

Oui, il est légal de faire ses factures sur Excel. La seule obligation est de respecter les règles de facturation : présence des mentions obligatoires, numérotation et conservation des documents. En revanche, Excel ne permet pas d'automatiser la numérotation, le suivi des paiements ou l'envoi des relances. Surtout, il ne peut pas générer de factures électroniques au format structuré requis par la réforme de 2026. Un logiciel de facturation compatible sera nécessaire pour continuer à facturer dans les règles.

La facturation électronique devient obligatoire progressivement à partir du 1er septembre 2026. À cette date, toutes les entreprises devront être capables de recevoir des factures électroniques. Les grandes entreprises et ETI devront aussi émettre leurs factures sous ce format. Les PME, TPE et micro-entreprises devront émettre leurs factures électroniques à partir du 1er septembre 2027.

La réforme impose d'utiliser un format électronique structuré et de passer par une plateforme agréée pour transmettre les factures. L'envoi d'une facture PDF par email ne sera plus suffisant. Ces règles visent à automatiser la transmission des informations et à lutter contre la fraude à la TVA.